El alto rendimiento molecular de las simulaciones esta enfocado en la investigación de como. Las moléculas interaccionan con las proteínas o el plegado de proteínas y su comportamiento. GPUGRID ha sido empleado en la investigación de tratamientos para enfermedades como cáncer, Alzheimer, y el COVID-19.
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GPGRID, proyecto de simulación computacional de proteínas abierto a la participación del internauta
GPGRID, proyecto de simulación computacional de proteínas abierto a la participación del internauta
Publicado
diciembre 10, 2010
por
Nomada Semillas
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Siguiendo modelos de proyecto colectivos desarrollados a partir de la utilizacion de los recursos informáticos con los que cuentan sus participantes y que aportan altruistamente como es el caso del proyecto SETI de rastreo de señáles de vida extraterrestre.
La iniciativa promovida por la Universitat Pompeu Fabra de Barcelona y desarrollada por el Grupo de Investigación Computacional. En este caso el objetivo de GPUGRID.
Que es como se llama denomina el proyecto, es analizar y describir el proceso de interacción del fármaco y el efecto sobre la proteína con el propósito de mejorar las características del fármaco y su régimen de actuación.
GPUGRID es un proyecto de computación distribuida que corre en la plataforma informática Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC). GPUGRID realiza simulaciones de biología molecular a escala átomica, está diseñado para funcionar en GPUs con CUDA. El soporte para el procesador Cell del PlayStation 3 y el proyecto subsiguiente PS3GRID fue abandonado en 2009 debido a una actualización de firmware del PS3 que previene la instalación de programas terceros que son requeridos.
Para realizar esta simulación se utiliza una herramienta computacional llamada Dinámica Molecular, lo que tiene que hacer el usuario es descargarse un programa por el que el usuario que se conecta permite que se aproveche el potencial de su tarjeta gráfica, para simular y analizar a escala atómica la interacción entre proteínas.
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